Intein Engineering for Protien Hydrogel Synthesis and Protein Purification

Inteins are proteins encoded within a precursor gene that excise themselves after translation and ligate the surrounding proteins with a peptide bond. Since their discovery two decades ago, many inteins have been engineered for various biotechnology applications. This dissertation focuses on the use and development of intein-based technologies for applications in protein purification and immobilization. The highly efficient naturally split DnaE intein from Nostoc punctiforme (Npu DnaE) was incorporated into synthetic protein building blocks for the synthesis of protein hydrogels, and engineered to catalyze rapid C-terminal cleavage reaction and used in the rapid purification of tag-less protein. In the first application, we developed protein hydrogels as general scaffolds for protein immobilization. Immobilization has been shown to increase protein stability and facilitate enzyme recovery-and-recycle tasks. These hydrogels are composed of artificial protein building-blocks expressed in bacterial hosts. Hydrogel gelation is catalyzed by intein-mediated protein trans-splicing reactions or disulfide bond formation between different protein building blocks. The resulting artificial protein hydrogels possess high solution stability at a wide range of pHs and temperatures, undergo shear-thinning, and are compatible with organic solvents. These self-assembled protein hydrogels can protect immobilized enzymes from organic solvent denaturation during biosynthesis, be used in enzymatic biofuel cells, and are suitable for the immobilization of multiple enzymes. In the second application, we engineered the Npu DnaE intein to catalyze rapid thio-induced C-terminal cleavage reaction and subsequently developed a split intein mediated technology for recombinant protein purification (SIRP). SIRP enables efficient purification of tag-less recombinant protein from E. coli lysate in less than 1 hour – the hitherto fastest reported intein technology for protein purification

La construcción social del derecho a la ciudad en el Distrito Federal

326 páginas. Doctorado en Sociología.Hoy en día la sociología como disciplina científica social resulta fundamental para comprender la gama de fenómenos sociales que se desarrollan en las sociedades contemporáneas y que van de las cuestiones triviales de la vida cotidiana al análisis de grandes procesos de orden global. La diversidad, dinamismo, heterogeneidad, complejidad y conflictividad de la realidad social nos obliga a hacer uso de las herramientas teórico-metodológicas de la sociología para hacer acercamientos más profundos y objetivos a las causas desarrollo e implicaciones de las acciones de los diversos grupos que componen el entramado social. Describir, interpretar y analizar fenómenos emergentes de la realidad social se convierte, en esta perspectiva, en una necesidad impostergable que le permite a los sociólogos dar cuenta de procesos sociales en curso que sin embargo, cuentan con elementos de carácter histórico que los determinan y que los potencian a la vez en una perspectiva de construcción de futuro

Estratégias de abordagem aos usuários de álcool e substâncias psicoativas para melhoria da Atenção a Saúde

O uso abusivo de psicotrópicos é um dos principais problemas de saúde pública em todo o mundo. O município de Uberaba consta com um sistema integrado de redes de atenção com a Estratégia de Saúde da Família como base do sistema. Na área de abrangência Gameleira 1 as doenças predominantes são: Problemas de saúde mental, em especial Dependência química, doenças cardiovasculares, câncer e problemas de saúde ambiental. Realizamos este trabalho para desenvolver um projeto de intervenção sobre as estratégias de abordagem aos usuários de álcool e substâncias psicotrópicas para melhoria da atenção à saúde da pessoa com dependência química, utilizando o método simplificado de Planejamento Situacional. Elaborou-se um plano de ação que envolveu o plano operativo voltado para a prevenção e redução de danos provocados pelo uso abusivo de álcool e substâncias psicotrópicas. O estudo do tema e a análise dos dados coletados permitiram um entendimento sobre o predomínio do consumo exagerado de substâncias psicotrópicas, também de aumentar os conhecimentos da equipe sobre a abordagem dos problemas de dependência química e estabelecer ações de apoio à família dos usuários de álcool e substâncias psicotrópicas para o acompanhamento desta condiçã

Las garantías penitenciarias dentro de los centros de rehabilitación social de Guayaquil

El Sistema de Rehabilitación Social en nuestro país tiene como finalidad la rehabilitación integral personas sentenciadas para posteriormente ser reinsertadas a la sociedad, Art. 201 de la Constitución vigente, por lo menos eso es el espíritu de la norma. Los centros penitenciarios tienen que contar obligatoriamente con una infraestructura adecuada, acorde a cada una de las necesidades y exigencias que demanda un conglomerado de personas que en un determinado momento por necesidad o simplemente ser víctimas de una sociedad injusta se vieron involucraron en el cometimiento de una infracción penal. Es aquí cuando el Estado a través de los diferentes Órganos Estales, como el Ministerio de Justicia, Derechos Humanos y Cultos, Centros de Rehabilitación Social, entre otros deberían cumplir un rol protagónico en el desarrollo de sus funciones, pero lastimosamente esto no ocurre de la mejor manera el hacinamiento le gana la batalla al sistema. En el presente trabajo de estudio demostraremos que con la vigencia del 10 de agosto de 2014 del nuevo Código Integral Penal que derogo al Código de Ejecución de penas, trae consigo dos nuevos beneficios penitenciarios como son el Régimen semiabierto, que tiene que ver con el cumplimiento del sesenta por ciento de la pena y el Régimen abierto que se aplica una vez que el sentenciado allá cumplido el ochenta por ciento de la pena; beneficios que en la práctica son muy poco aplicables a favor de este grupo vulnerable, o para decirlo mejor son muy poco acogidos por los jueces de Garantías Penitenciarias, esto debido a que estos centros penitenciarios no cuentan con la infraestructura suficiente para poder solventar las necesidades de los internos, y esto, implica que no puedan acceder a los ejes de tratamiento que señala y exige la ley para beneficiarse, y de esta manera obtener su tan ansiada libertad antes del cumplimiento total de su pena, previo al requerimiento judicial ante juez competente

Factores asociados a derrame pleural en pacientes del programa de control de tuberculosis del Hospital Nacional Dos de Mayo en el periodo Julio 2015 - Junio 2016

Introducción: El derrame pleural tuberculoso constituye la manifestación extrapulmonar más frecuente de la tuberculosis (TB) en nuestro país. En el Perú, entre los años 2013 y 2014, se reportaron casi un 18% de casos de tuberculosis extrapulmonar. Del total de casos notificados como TB extrapulmonar, el mayor porcentaje (54%) tuvieron localización pleural, seguida de ganglionar (11.1%) y del sistema nervioso (9%). Siendo la Tuberculosis Pleural la localización extrapulmonar más frecuente de la tuberculosis, actualmente no existen estudios que hayan determinado los factores asociados al desarrollo de TB pleural (derrame pleural tuberculoso) en el Perú. Por lo tanto, se plantea la necesidad de determinar los factores asociados a Derrame Pleural Tuberculoso en pacientes del Programa de Control de Tuberculosis (PCT) del Ministerio de Salud (MINSA) del Hospital Nacional Dos de Mayo. Objetivo: Determinar los factores asociados a derrame pleural tuberculoso en pacientes del Programa de Control de Tuberculosis del Hospital Nacional Dos de Mayo en el periodo Julio 2015-Junio 2016. Metodología: Se realizó un estudio retrospectivo, observacional, analítico, transversal, censal. Se contó con una población de 611 pacientes con diagnóstico de tuberculosis, de los cuales 110 pacientes tuvieron el diagnóstico de derrame pleural tuberculoso y 501 alguna forma de tuberculosis de distinta localización a la pleural (pulmonar o extrapulmonar) Resultados: La coinfección con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) demostró estar asociada al derrame pleural tuberculoso (p=0.004; OR=1.89; IC95% 1.22-2.93), mientras que el sexo (p=0.74; OR=0.74 IC95% 0.69-1.68), la edad (p=0.18; OR=1.32 IC95% 0.87-2.00 y la diabetes mellitus (p=0.75; OR=1.10 IC95% 0.58-2.11) no fueron factores asociados a la presencia del mismo. Conclusión: La coinfección con el VIH es un factor de riesgo asociado a derrame pleural tuberculoso en pacientes del Programa de Control de Tuberculosis del Hospital Nacional Dos de Mayo en el periodo Julio 2015-Junio 2016.Tesi

Representing radar rainfall uncertainty with ensembles based on a time-variant geostatistical error modelling approach

The application of radar quantitative precipitation estimation (QPE) to hydrology and water quality models can be preferred to interpolated rainfall point measurements because of the wide coverage that radars can provide, together with a good spatio-temporal resolutions. Nonetheless, it is often limited by the proneness of radar QPE to a multitude of errors. Although radar errors have been widely studied and techniques have been developed to correct most of them, residual errors are still intrinsic in radar QPE. An estimation of uncertainty of radar QPE and an assessment of uncertainty propagation in modelling applications is important to quantify the relative importance of the uncertainty associated to radar rainfall input in the overall modelling uncertainty. A suitable tool for this purpose is the generation of radar rainfall ensembles. An ensemble is the representation of the rainfall field and its uncertainty through a collection of possible alternative rainfall fields, produced according to the observed errors, their spatial characteristics, and their probability distribution. The errors are derived from a comparison between radar QPE and ground point measurements. The novelty of the proposed ensemble generator is that it is based on a geostatistical approach that assures a fast and robust generation of synthetic error fields, based on the time-variant characteristics of errors. The method is developed to meet the requirement of operational applications to large datasets. The method is applied to a case study in Northern England, using the UK Met Office NIMROD radar composites at 1 km resolution and at 1 h accumulation on an area of 180 km by 180 km. The errors are estimated using a network of 199 tipping bucket rain gauges from the Environment Agency. 183 of the rain gauges are used for the error modelling, while 16 are kept apart for validation. The validation is done by comparing the radar rainfall ensemble with the values recorded by the validation rain gauges. The validated ensemble is then tested on a hydrological case study, to show the advantage of probabilistic rainfall for uncertainty propagation. The ensemble spread only partially captures the mismatch between the modelled and the observed flow. The residual uncertainty can be attributed to other sources of uncertainty, in particular to model structural uncertainty, parameter identification uncertainty, uncertainty in other inputs, and uncertainty in the observed flow.</p

The importance of using models in the teaching and learning process of the nature of light

Analysis of registered experiences on orienting a course –“the problem of light”- is presented with the aim at contributing to overcome failures related with wrong ideas both for teachers and students. Both the students and teachers are orientated in the study of the nature of light throughout the knowledge of the different models or theories explaining the light phenomena in order to have a significant learning and make a change both conceptual and methodological so it can be applied in their basic, medium or superior education work

Evaluación económica de la producción de mojarra castarrica en palizada, Campeche, México

El presente trabajo de investigación se realizó en la organización de productores denominada Producción pesquera y acuícola de bienes y servicios acuacultores de la Rivera Alta S.C. de R.L. de C.V. en Palizada, Campeche, México; el cual tiene como propósito determinar la rentabilidad del proyecto de inversión de mojarra castarrica para informar si los recursos que se invirtieron han permitido capitalizar a los miembros de la Sociedad Cooperativa. Por lo anterior, se calcularon los indicadores de rentabilidad que se establecen en la metodología para la formulación y evaluación de proyectos de inversión para medir la rentabilidad de la organización de productores, los cuales son: Valor Actual Neto (VAN), Relación Beneficio Costo (B/C), Relación Beneficio-Inversión Neta (N/K) y la Tasa Interna de Retorno (TIR). Los resultados obtenidos en un periodo de análisis de 10 años son: VAN = 563,743; B/C = 1.34; N/K = 8.79 y la TIR = 141.6%. Al efectuarse el análisis de sensibilidad a la estructura de ingresos y costos totales se observó que el proyecto puede sufrir una disminución de los ingresos de alrededor de 20% siendo rentable y por el lado de los costos totales puede tener un aumento de alrededor de 20% y muestra redituabilidad